古文化厅一层，共分“序言”、“六千年前的上海人”和“五千年前的上海人”三大部分，以崧泽文化为重点，通过复原最早上海人的生存环境、崧泽文化先民的生活场景，利用多媒体等手段，展出崧泽遗址出土的各类文物二百余件，详细介绍了上海成陆过程。马家浜文化和崧泽文化时期上海先民的生产生活状况，充分反映了上海的悠久历史。
       古文化厅二层，共分“四千年前的上海人”、“三千年前的上海人”和“余韵曼衍”三大部分，以良渚文化为重点，通过复原福泉山、良渚文化祭祀和治玉场景，利用多媒体手段，展出福泉山等遗址出土的玉、陶、石器等精美文物三百余件。详尽介绍了良渚文化至汉代上海先民的生产生活状况，充分反先民的灿烂文化。“上下两层”内容一脉相承，通俗易懂，让观众踏着先民足迹，清楚地了解古代上海文明发展的轨迹。